Транспортная милиция - выполняет задачи по обеспечению правопорядка на транспорте: железнодорожном, речном, морском, воздушном и территориях, прилегающих к местам его функционирования (вокзалам,мор,речпортам, аэропортам и полосах отвода).
Налоговая- в сфере соблюдения налогового законодательства, (сокрытие доходов от налогообложения, фальсификаты т.д).
Вы, наверное вместо транспортной милиции, имели ввиду транспортную инспекцию. Так её задача- контроль за соблюдением законодательства, действующего на транспорте.